前に、yum/rpmコマンドでファイルがどのパッケージに含まれるか、逆にパッケージを指定してどのようなファイルが展開されるかについて書いたので、今回はapt/dpkgコマンドで同様のことをする方法について残しておく。

1. 指定したファイル名がどのパッケージに含まれるかを調べる

指定したファイル名がどのパッケージに含まれるか(yumでいうprovides)を調べる場合、aptで行う場合はそのものズバリな機能はないため、apt-fileという別のプログラムを利用する必要があるようだ。 以下のコマンドでインストールできる。

sudo apt install apt-file
sudo apt-file update

インストール後、以下のようにapt-fileを実行することで指定したファイルを提供しているパッケージを検索できる。

apt-file search ファイル名

blacknon@bs-pub-ubuntu-03:~$ apt-file search Rscript
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/lengths.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/mapDamage.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/checkLibraries.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/data.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/function.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/main.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/postConditonal.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/priorPropose.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/runGeneral.R
mapdamage: /usr/lib/python2.7/dist-packages/mapdamage/Rscripts/stats/start.R
r-base-core: /usr/bin/Rscript
r-base-core: /usr/lib/R/bin/Rscript
r-base-core: /usr/share/man/man1/Rscript.1.gz
transdecoder: /usr/lib/transdecoder/util/PWM/make_seqLogo.Rscript
transdecoder: /usr/lib/transdecoder/util/PWM/plot_ROC.Rscript
transdecoder: /usr/lib/transdecoder/util/misc/rpart_scores.Rscript
trinityrnaseq: /usr/lib/trinityrnaseq/Analysis/DifferentialExpression/GOplot.Rscript
trinityrnaseq: /usr/lib/trinityrnaseq/Analysis/DifferentialExpression/Glimma.Trinity.Rscript
trinityrnaseq: /usr/lib/trinityrnaseq/Analysis/DifferentialExpression/plot_all_DE_MAplots.Rscript
trinityrnaseq: /usr/lib/trinityrnaseq/Analysis/DifferentialExpression/plot_all_DE_volcanos.Rscript
trinityrnaseq: /usr/lib/trinityrnaseq/Analysis/DifferentialExpression/validate_UP_subset.Rscript
trinityrnaseq: /usr/lib/trinityrnaseq/util/misc/plot_ExN50_statistic.Rscript
trinityrnaseq: /usr/lib/trinityrnaseq/util/misc/plot_strand_specificity_dist_by_quantile.Rscript

インストール済のパッケージから調べる場合は、以下のようにdpkgコマンドから調べることができる。 パッケージ名やディレクトリ名からも検索してしまうので、ちゃんとPATHを指定しないとノイズが多いので注意。

dpkg -S ファイル名

blacknon@bs-pub-ubuntu-03:~$ dpkg -S $(which ls)
coreutils: /bin/ls

2. 指定したパッケージにどのようなファイルが含まれているかを調べる

先ほどとは逆に、指定したパッケージにどのようなファイルが含まれているかリストにして出力する場合。 aptで調べる場合、やはり先程と同じようにapt-fileで調べることになる。

apt-file list パッケージ名

blacknon@bs-pub-ubuntu-03:~$ apt-file list coreutils
coreutils: /bin/cat
coreutils: /bin/chgrp
coreutils: /bin/chmod
coreutils: /bin/chown
coreutils: /bin/cp
coreutils: /bin/date
coreutils: /bin/dd
coreutils: /bin/df
coreutils: /bin/dir
coreutils: /bin/echo
coreutils: /bin/false
coreutils: /bin/ln
coreutils: /bin/ls
...

インストール済のパッケージから提供しているファイルの一覧を取得する場合は、以下のようにdpkgコマンドを実行する。

dpkg -L パッケージ名

blacknon@bs-pub-ubuntu-03:~$ dpkg -L coreutils
/.
/bin
/bin/cat
/bin/chgrp
/bin/chmod
/bin/chown
/bin/cp
/bin/date
/bin/dd
/bin/df
/bin/dir
...